分子动态与稳态结构国家重点实验室是在原北京大学化学系结构化学开放实验室和中国科学院化学研究所动态结构实验室的基础上, 于1987年3月通过专家论证，经国家计委正式批准成立的。实验室于1991年通过国家验收并正式对外开放，是中国科学院与高等学校联合建立的第一批国家重点实验室之一。重点实验室经过多年的努力，已建立起一支年龄、专业和层次结构合理的研究队伍。
实验室主持并承担多项国家重大项目，包括攀登项目，973项目，863项目，国家自然科学基金重大项目、重大仪器专项、重点课题、面上项目，国家***科学基金，教育部教育振兴项目，中国科学院方向性创新项目以及中国科学院战略先导专项等。
实验室长期致力于开拓国内外学术交流渠道，通过执行国家级国际合作项目和承担国家科研任务,与国内外高水平研究机构和科学家进行合作研究，在提升重点实验室科研水平和培养人才方面发挥了重要作用。实验室的目标是在分子动态与稳态结构的基础研究及应用基础研究方面取得具有创新性的重要成果，成为国际结构化学研究领域具有重要影响力的研究中心及团体之一。
重点实验室化学所部分的主要研究方向为复杂体系分子动态学与动态结构化学。目前实验室的主要研究领域包括：大气物理化学、团簇化学与分子多相催化、生物体系中自由基行为及其生理功能的分子机制、复杂分子体系量子动力学的理论研究、结构化学生物学、介观凝聚态及质谱光谱学、理论金属有机化学与均相催化、功能体系的结构、表面和过程研究等。重点实验室化学所部分现有固定人员29人，现有物理化学学科硕士点、博士点和博士后流动站，有博士生导师9人。
